Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a5Q63ZW6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms