Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic2Q62520 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic2Q62520 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms