Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ss18Q62280 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ss18Q62280 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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