Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarcd1Q61466 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smarcd1Q61466 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms