Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cd53Q61451 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms