Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Irf9Q61179 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms