Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxd3Q61060 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxd3Q61060 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms