Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf3Q60980 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf3Q60980 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf3Q60980 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Klf3Q60980 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf3Q60980 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf3Q60980 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf3Q60980 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf3Q60980 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf3Q60980 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf3Q60980 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf3Q60980 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms