Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JrkQ60976 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
JrkQ60976 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms