Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms