Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf8Q60846 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms