Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms