Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irgm1Q60766 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irgm1Q60766 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irgm1Q60766 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irgm1Q60766 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irgm1Q60766 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Irgm1Q60766 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irgm1Q60766 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms