Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms