Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sin3aQ60520 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sin3aQ60520 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms