Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggnbp2Q5SV77 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggnbp2Q5SV77 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms