Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sco1Q5SUC9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sco1Q5SUC9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms