Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm12253Q5NC48 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms