Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc38a8Q5HZH7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc38a8Q5HZH7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms