Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hs3st6Q5GFD5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms