Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm2Q5FW85 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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