Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpm3Q5F4S9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Trpm3Q5F4S9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Trpm3Q5F4S9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpm3Q5F4S9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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