Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss53Q571E5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss53Q571E5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms