Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q4VA45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q4VA45 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q4VA45 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q4VA45 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q4VA45 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q4VA45 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q4VA45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q4VA45 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms