Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Snhg11Q4G0K9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snhg11Q4G0K9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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