Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp48Q3V0C5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp48Q3V0C5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms