Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms