Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap1Q3UUV5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap1Q3UUV5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms