Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Obox3Q3UT54 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Obox3Q3UT54 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Obox3Q3UT54 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms