Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm20Q3UQS8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms