Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q3UPC7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms