Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlrc4Q3UP44 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms