Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrch2Q3UMG5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms