Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms