Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CrxosQ3UL53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms