Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms