Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b2Q3UJB0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms