Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Greb1Q3UHK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms