Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms