Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5113Q3UGK8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms