Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Puf60Q3UEB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms