Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trafd1Q3UDK1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trafd1Q3UDK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms