Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U6N9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms