Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VwceQ3U515 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VwceQ3U515 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms