Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms