Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc174Q3U155 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms