Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms