Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf6Q3TWW8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms