Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21440Q3TTD8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm21440Q3TTD8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21440Q3TTD8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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