Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CiartQ3TQ03 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CiartQ3TQ03 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms